阿根廷出血热的病因是人体感染胡宁病毒，该病毒属沙粒病毒科，自然宿主为长尾稻鼠等啮齿动物。病毒主要通过接触带毒鼠类排泄物尿液、粪便等污染的空气气溶胶、破损皮肤黏膜或被污染的食物侵入人体，也可通过实验室暴露感染，一般无明确的持续人传人传播现象。
阿根廷出血热的核心发病原因分为两大方面，一是感染特定病原体，二是通过易感途径接触病毒，两类因素共同构成发病的必要条件。
其核心原因可分为2条
1.感染胡宁病毒占比100%：胡宁病毒是沙粒病毒科的成员，是阿根廷出血热的唯一致病病原体，人体感染该病毒是发病的根本前提，未感染该病毒则不会罹患该病。该病毒在野生啮齿动物主要为长尾棉鼠体内自然循环，具备跨物种传播至人类的特性。
2.接触带毒啮齿动物的污染物占比约90%：人类主要通过吸入含病毒的气溶胶、摄入被病毒污染的食物或水源，或破损皮肤黏膜接触带毒啮齿动物的排泄物尿液、粪便、唾液等而感染；无此类暴露史的人群不会因其他途径患病。
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