慢性类鼻疽的病因明确：病原体为类鼻疽伯克霍尔德菌，该菌广泛分布于热带如东南亚、澳大利亚北部的土壤及水体中。主要感染途径包括皮肤破损接触被污染的土壤或水体、吸入带菌气溶胶、进食被污染的水或食物。免疫力低下人群如糖尿病患者、艾滋病患者、长期使用免疫抑制剂者易感染，感染后常呈慢性病程。
慢性类鼻疽的核心原因是特定病原体持续感染及机体免疫防御缺陷共同作用，具体为类鼻疽伯克霍尔德菌长期定植体内引发的慢性炎症，以及免疫功能下降导致的病原体无法被彻底清除，二者协同诱发慢性病程。
其核心原因可分为2条
1.类鼻疽伯克霍尔德菌持续感染占比约75%：该菌广泛分布于热带、亚热带地区的土壤和水体中，慢性类鼻疽患者多有长期暴露于污染环境的经历，病原体侵入人体后未被免疫系统完全清除，在组织器官内持续定植、繁殖，逐渐形成慢性化脓性炎症或肉芽肿病变，是病程转为慢性的主要原因。
2.机体免疫功能低下占比约25%：当机体存在糖尿病、慢性肝肾疾病、长期使用糖皮质激素或免疫抑制剂、过度酗酒等免疫受损状态时，固有免疫和适应性免疫应答能力下降，无法有效杀灭入侵的类鼻疽伯克霍尔德菌，使急性感染难以痊愈，进而迁延为慢性病程。
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