流行性肌痛的病因主要为病毒感染，其中以柯萨奇病毒B组最为多见，其次为埃可病毒等肠道病毒；部分病例也可由呼吸道合胞病毒、腮腺炎病毒、腺病毒等其他病毒感染引发，病原体多通过呼吸道飞沫或粪口途径侵入人体致病。
流行性肌痛的核心原因主要以病毒感染为主，多发生在夏秋季，通过呼吸道、粪口等途径传播，儿童、青少年为高发人群，部分病例可呈流行性发病。
其核心原因可分为2条。
1.肠道病毒感染占比90%以上
具体原因解释：流行性肌痛最主要的致病原为肠道病毒属的病原体，其中柯萨奇B组病毒是最常见亚型，其次为埃可病毒等。这些病毒侵入人体后，易侵犯胸壁肌肉、膈肌及胸膜等组织，引发局部炎症反应，进而导致特征性阵发性肌痛多为胸痛、腹痛，活动或呼吸时加重，是引发该病流行的主要原因。
2.其他病毒感染占比不足10%
具体原因解释：少数情况下，流感病毒、腺病毒等其他病毒感染也可能诱发类似流行性肌痛的症状，但此类病例较为少见，通常为散发性，症状相对温和，病程较短，无明显流行特征。
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