后睾吸虫病的病因是人体感染后睾吸虫属寄生虫，常见如猫后睾吸虫、东方次睾吸虫等。多因食用生的或未彻底煮熟的含有后睾吸虫囊蚴的淡水鱼虾，囊蚴经消化道进入人体后，在肝胆管内发育为成虫，成虫寄生在肝胆管引发炎症等病变，从而致病。
后睾吸虫病主要是因人体感染后睾属吸虫，核心是摄入其感染期的囊蚴。绝大多数感染源于生食或半生食含囊蚴的淡水鱼虾，少数源于交叉污染或食用带囊蚴的其他水生生物。
其核心原因可分为2条
1.生食或半生食含后睾吸虫囊蚴的淡水鱼虾占比约90%：后睾吸虫的囊蚴寄生于鲤科等淡水鱼类的肌肉、内脏及皮下组织，若食用未彻底煮熟、腌透、生腌的这类鱼虾，囊蚴无法被灭活，进入人体消化道后脱囊，经胆道迁移至胆管、胆囊内寄生，发育为成虫引发病变。
2.交叉污染或摄入被囊蚴污染的食物占比约10%：若处理生鱼虾的刀具、砧板未充分清洁，直接接触入口的熟食，残留的囊蚴可污染食物导致感染；部分情况下生食含囊蚴的淡水螺等水生生物，也可能造成感染，但感染概率较低。
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