非洲锥虫病症状分两阶段：血淋巴期初期，叮咬处出现疼痛性红肿下疳，数天至数周后突发发热、剧烈头痛、关节痛、乏力，伴皮疹、颈部淋巴结肿大Winterbottom征；脑膜脑炎期出现持续性头痛、异常嗜睡、性格改变、行为异常，可有言语障碍、共济失调，晚期进展为昏迷、抽搐、瘫痪，未规范治疗可致死。
非洲锥虫病的常见并发症包括：贫血、心肌炎、脑膜炎、中枢神经系统功能紊乱、急性肾衰竭、呼吸衰竭、严重营养不良及恶病质等，未及时治疗可进展为多种危及生命的重症，需关注脏器功能异常。
1.贫血：非洲锥虫病病原体大量繁殖时破坏红细胞，同时触发免疫介导的溶血反应，导致红细胞计数及血红蛋白水平进行性降低，早期即可出现乏力、头晕等贫血表现。
2.心肌炎：锥虫及其代谢产物侵犯心肌组织引发炎症，损伤心肌细胞，影响心脏收缩舒张功能，可出现心悸、胸闷、心律失常，严重时诱发心力衰竭，是中晚期重要并发症。
3.脑膜炎：锥虫突破血脑屏障侵入中枢神经系统后，引发脑膜炎症，患者表现为剧烈头痛、呕吐、颈项强直等脑膜刺激征，重症者可出现意识障碍、惊厥。
4.中枢神经系统功能紊乱：又称昏睡病相关神经综合征，锥虫破坏脑组织与神经细胞，影响神经系统调节功能，出现嗜睡、昏迷、性格改变、肢体共济失调等症状，是晚期典型并发症。
5.急性肾衰竭：锥虫感染引发全身炎症反应，影响肾脏血液灌注，同时损伤肾间质，导致肾功能急剧下降，出现少尿、无尿、电解质紊乱等表现，危及生命。
6.呼吸衰竭：病情严重时，中枢神经系统受损影响呼吸中枢调节，或继发肺部感染，导致通气换气功能障碍，出现呼吸困难、低氧血症，甚至呼吸停止。
7.严重营养不良及恶病质：疾病影响消化吸收功能，加上持续发热消耗，导致体重急剧下降、极度消瘦，发展为恶病质，进一步降低免疫力，加重感染风险。
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