新疆出血热起病急，潜伏期通常2-10天，发病后出现高热，体温可达39℃-41℃，多为稽留热或双峰热，伴剧烈头痛、腰痛、眼眶痛等全身中毒症状，面、颈、胸部皮肤呈潮红表现；多数患者有皮肤黏膜出血，如软腭、腋下针尖样出血点，严重者可出现鼻出血、牙龈出血、呕血、便血，部分还伴恶心、呕吐、腹痛等胃肠道症状。
新疆出血热的常见并发症包括出血倾向进行性加重、急性肾衰竭、急性呼吸窘迫综合征肺水肿相关、中枢神经系统损害脑水肿、病毒性脑炎、继发感染、感染性休克及多器官功能障碍综合征等。
1.出血倾向进行性加重：本病由病毒侵袭导致血管内皮广泛损伤，凝血、抗凝及纤溶系统紊乱，可先出现皮肤瘀斑、牙龈出血，病情进展中可出现消化道出血、咯血，甚至颅内出血，严重危及生命。
2.急性肾衰竭：病毒及毒素直接损伤肾实质细胞，加上发热、出血等导致有效循环血量不足，引发肾功能急剧下降，表现为少尿或无尿、血尿素氮及肌酐升高、电解质紊乱等。
3.急性呼吸窘迫综合征：肺血管通透性异常升高，肺组织间隙及肺泡内大量液体渗出，导致进行性呼吸困难、低氧血症，需氧疗或机械通气支持，是本病常见的危重并发症之一。
4.中枢神经系统损害：病毒侵犯中枢神经系统或脑微循环障碍引发脑水肿，可出现剧烈头痛、喷射性呕吐、意识模糊、抽搐，严重时可导致脑疝危及生命。
5.继发感染：患者因免疫功能抑制、住院期间侵入性操作等，易合并肺部、泌尿系统等部位的细菌或真菌感染，加重病情进展。
6.感染性休克及多器官功能障碍综合征：严重病毒感染导致微循环衰竭，出现血压下降、四肢湿冷等休克表现，进而引发心、肝、肾等多器官功能同时或相继衰竭，是本病致死的主要原因。
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