生殖器疱疹分为原发性和复发性感染，原发性感染潜伏期2-14天，生殖器或肛周先出现局部烧灼感，继而出现红斑、簇集性小水疱，水疱破溃后形成糜烂或浅溃疡，伴明显疼痛，可伴随发热、乏力、腹股沟淋巴结肿大等全身症状；复发性感染症状较轻，水疱数量少、病程短，疼痛轻微，通常无明显全身不适。
生殖器疱疹常见并发症包括：泌尿生殖系统感染如尿道炎、膀胱炎、盆腔炎、播散性疱疹如疱疹性脑膜炎、疱疹性肝炎、新生儿疱疹、HIV感染风险升高，以及长期心理焦虑、抑郁等。
1.尿道炎：男性生殖器疱疹病毒可侵犯尿道黏膜，引发尿道炎症，出现尿频、尿急、尿痛、尿道分泌物增多，若反复感染还可能导致尿道狭窄，影响排尿功能。
2.膀胱炎：病毒累及膀胱黏膜时，可引发膀胱炎，表现为下腹部坠胀、尿频、尿急加重，部分患者伴有血尿，病程迁延易转为慢性炎症。
3.盆腔炎：女性患者若病毒上行感染盆腔生殖器官，会引发盆腔炎，出现下腹部持续性疼痛、腰骶部酸痛、阴道异常分泌物，严重时可导致输卵管粘连，增加不孕或异位妊娠的风险。
4.播散性疱疹：当患者免疫力低下时，病毒可侵入血液循环播散至全身，引发疱疹性脑膜炎出现头痛、呕吐、意识模糊等、疱疹性肝炎肝区疼痛、肝功能指标异常等，病情危重可危及生命。
5.新生儿疱疹：孕期女性感染生殖器疱疹，病毒可经胎盘感染胎儿，或分娩时经产道传给新生儿，导致新生儿皮肤疱疹、脑炎等，病死率高达50%以上，幸存者常留下神经系统后遗症。
6.HIV感染风险升高：生殖器疱疹造成的皮肤黏膜破损，会破坏人体抵御HIV的屏障，大幅增加HIV病毒入侵感染的概率，是性传播疾病中HIV感染的重要协同因素。
7.心理问题：生殖器疱疹作为慢性复发性性传播疾病，易使患者产生羞耻感、焦虑、抑郁等心理负担，影响日常生活及人际交往，降低生活质量。
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