生殖器疱疹的治疗以抗病毒为主，原发性感染可口服阿昔洛韦、伐昔洛韦或泛昔洛韦，疗程7-10天；复发性感染需在皮疹出现24小时内用药，疗程5天；频繁复发者可长期抑制抗病毒治疗，持续4-12个月。疼痛明显者可口服布洛芬等止痛药，局部保持清洁干燥，继发细菌感染时可外用抗生素软膏，治疗期间避免劳累、饮酒及性生活以防传播。
生殖器疱疹的治疗周期是一个长期管理周期，核心目标是缓解临床症状、减轻皮损疼痛、缩短发作病程、降低复发频率及性传播风险。典型的治疗周期如下：
1.初发感染阶段：针对首次出现生殖器疱疹症状的患者，治疗周期为短期7-10天，采用口服核苷类抗病毒药物如阿昔洛韦、伐昔洛韦，配合局部护理保持皮损清洁干燥、预防继发感染，通常可控制急性症状，但需规范完成疗程，避免因治疗不彻底增加后续复发概率；
2.复发发作阶段：针对每年复发次数少于6次的复发性生殖器疱疹患者，发作期治疗周期为5天左右，在皮疹出现24小时内启动抗病毒治疗，快速减轻发作症状、缩短病程；
3.长期抑制阶段：针对每年复发次数≥6次的频繁复发性生殖器疱疹患者，需接受长期抗病毒抑制治疗，周期为6-12个月，采用每日口服抗病毒药物的方案，期间需定期复诊评估，若治疗后复发频率显著降低可在医生指导下逐步调整方案，不可自行停药或增减药量；
此外，无论处于哪个治疗阶段，患者都需配合生活方式调整如规律作息、避免熬夜饮酒、适度运动等，长期规避诱发因素，维持病情稳定，降低复发对生活质量的影响。
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