巴尔通体病治疗以抗菌药物及对症支持为核心：轻症猫抓病可自愈，症状显著者予多西环素、利福平口服；战壕热、杆菌性血管瘤病等需规范使用抗生素，疗程2～4周；合并脓肿者需行引流术，发热者辅以解热镇痛等对症处理。所有用药及操作需遵医嘱，不可自行处置。
巴尔通体病的治疗周期是一个短期，核心目标是彻底清除巴尔通体病原菌，缓解发热、淋巴结肿大等临床症状，预防内脏损伤等严重并发症。典型的治疗周期如下：
1.常规治疗周期：针对免疫功能健全患者的轻症巴尔通体感染如临床常见的猫抓病，采用敏感抗菌药物如阿奇霉素、多西环素进行规范治疗，典型疗程为2-4周；治疗期间需每1-2周复诊，评估症状改善情况及病原菌清除状态，完成足疗程用药后多数患者可达到临床治愈，无需长期维持治疗。
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