输尿管结石的病因主要有：多数结石来源于肾结石，少数原发于输尿管；尿液中钙、草酸、尿酸等结晶物质浓度过高，尿液pH值异常如尿酸结石时pH偏低、磷酸盐结石时pH偏高；输尿管狭窄、梗阻致尿液淤滞，结晶沉积；长期饮水不足、尿量减少，高动物蛋白、高盐饮食，或长期服用维生素C、磺胺类药物；甲状旁腺功能亢进等代谢异常引发高钙血症，也可诱发结石形成。
输尿管结石的形成，核心是尿液中结石成分浓度升高、抑制结石形成的物质不足或尿路环境异常，导致晶体沉积聚集，其核心原因可分为3条。
1.代谢异常占比约60%-70%：人体钙、草酸、尿酸等物质的代谢紊乱，使尿液中草酸钙、磷酸钙、尿酸等结石核心成分过量排出，超出尿液溶解度后析出结晶，逐渐聚集成型；如原发性甲状旁腺功能亢进患者钙磷代谢异常，会大幅增加含钙结石的发病风险。
2.尿路局部因素占比约15%-20%：存在尿路梗阻、感染、异物等局部病变时，尿液流动缓慢或淤积，晶体易停留沉积；尿路感染产生的炎性坏死组织、尿路手术遗留的缝线等，可作为结石核心促进晶体附着生长。
3.饮食与生活习惯占比约10%-15%：长期高钙、高草酸、高嘌呤饮食，每日饮水量不足导致尿液持续浓缩，或是长期久坐、缺乏运动，影响尿路中晶体的自然排出；比如常食用菠菜、浓茶、动物内脏等，会增加结石形成的概率。
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