肉毒中毒的病因主要是接触肉毒梭菌产生的毒素，具体包括：食源性病因是进食被肉毒梭菌污染的食物，如家庭自制发酵食品、未彻底灭菌的罐头等，细菌在厌氧条件下繁殖产毒；婴儿型多因婴儿摄入被肉毒梭菌污染的蜂蜜等，细菌在肠道定植产毒；创伤型为肉毒梭菌污染伤口，在厌氧环境下产毒；医源性则是不当注射肉毒毒素美容等导致毒素过量摄入。
肉毒中毒是肉毒梭菌产生的肉毒毒素引发的严重神经毒性疾病，核心致病环节为肉毒毒素阻断神经递质释放，致病原因主要与毒素摄入或肉毒梭菌感染相关，具体核心原因如下：
其核心原因可分为3条
1.食源性肉毒中毒占比约80%
该类型为临床最常见类型，肉毒梭菌广泛存在于土壤、水体中，食物被污染后经厌氧环境如密封腌制、罐装加工大量繁殖并产生预成型毒素，人体摄入含毒素的食物如家庭自制发酵豆制品/肉制品、变质罐头、污染的真空包装食品等后引发中毒。
2.伤口型肉毒中毒占比约10%
皮肤黏膜破损的伤口被肉毒梭菌芽孢污染，局部形成的厌氧环境促使芽孢萌发繁殖并产生毒素，毒素入血后引发全身中毒，常见于外伤后处理不当、注射非法来源的美容用肉毒素制剂等情况。
3.婴儿型肉毒中毒占比约10%
多见于6月龄以内婴儿，其肠道菌群尚未完全建立完善，若摄入含肉毒梭菌芽孢的物质如未经充分加热消毒的蜂蜜，芽孢在肠道内定植繁殖并产生毒素，引发神经毒性症状，是婴儿肉毒中毒的核心致病类型。
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