短肠综合征的诊断依据主要有：存在广泛小肠切除或小肠严重损伤的病史；残留功能性小肠过短，成人通常不足100cm，儿童需结合体重、年龄综合评估；出现典型消化吸收障碍表现，如顽固性腹泻、脂肪泻、体重下降、营养不良、水电解质紊乱；同时排除乳糜泻、慢性胰腺炎等其他可导致吸收不良的疾病。
短肠综合征诊断流程包括
1.临床病史采集与体征评估
详细采集患者小肠手术史含切除病因、部位、长度，询问术后每日腹泻量、体重变化、有无脱水或营养不良表现，查体关注体重指数、肌肉萎缩、皮肤弹性、脱水征等，初步筛查与疾病相关的核心线索。
2.实验室检查
完善营养相关指标白蛋白、前白蛋白、转铁蛋白判断营养状态，检测钠、钾、镁等电解质排查紊乱，行粪脂定量试验明确脂肪吸收不良，结合血常规评估有无贫血，必要时加测小肠细菌过度生长相关指标辅助判断。
3.影像学及内镜检查
通过小肠钡剂造影、CT或磁共振小肠造影测量剩余小肠长度，评估肠道形态有无狭窄、扩张等异常；行小肠镜或胶囊内镜直接观察剩余小肠黏膜状态，排查黏膜萎缩、炎症等病变，确认肠道结构异常情况。
4.功能评估与鉴别诊断
开展糖吸收试验等评估肠道吸收能力，行氢呼气试验排查小肠细菌过度生长，同时与慢性胰腺炎、炎症性肠病、肠易激综合征等有类似腹泻、营养不良症状的疾病鉴别，排除干扰因素后明确诊断。
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