十二指肠梗阻的病因分为先天性和后天性两类。先天性病因包括十二指肠闭锁、肠狭窄、先天性肠旋转不良等；后天性病因常见的有腹部手术后肠粘连、消化性溃疡愈合后的瘢痕狭窄、十二指肠或邻近器官肿瘤的压迫、异物或蛔虫团堵塞肠腔，还包括肠系膜上动脉压迫综合征等。
十二指肠梗阻的核心致病因素涵盖先天发育异常、后天器质性病变及功能性压迫三类，会导致十二指肠内容物无法正常通过，引发腹痛、呕吐、腹胀等症状，临床需针对病因开展干预。
其核心原因可分为3条
1.先天性十二指肠发育异常占比约25%，多因胚胎时期消化道发育畸形所致，如十二指肠闭锁、狭窄、肠旋转不良等，是婴幼儿十二指肠梗阻的主要病因，常合并其他消化道结构异常。
2.后天器质性病变占比约50%，为成人十二指肠梗阻的最常见原因，包括腹部术后的肠粘连、胰头癌/十二指肠恶性肿瘤的压迫、结石嵌顿于十二指肠壶腹部等，直接造成肠腔机械性阻塞。
3.肠系膜上动脉压迫综合征占比约25%，属于特殊类型的机械性梗阻，因肠系膜上动脉与腹主动脉夹角过小，压迫十二指肠横部，阻碍肠内容物通过，多见于长期消瘦或体型苗条的人群。
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