慢性肠炎主要表现为反复消化道症状及轻度全身症状：消化道症状包括脐周或下腹部隐痛/胀痛发作无规律、腹泻每日数次至十余次，大便呈糊状、水样或黏液便，部分带脓血、腹胀、嗳气、恶心呕吐；全身症状可见乏力、消瘦、轻度贫血，病程较长者偶有低热，部分患者伴里急后重感便意频繁但排便量少。
慢性肠炎若未规范治疗或病情迁延，可引发多种并发症，常见的包括肠道出血、肠穿孔、肠道狭窄/梗阻、营养不良、水电解质紊乱、肛周病变、肠道菌群失调、贫血，部分长期慢性炎症刺激还可能增加肠道癌变风险。
1.肠道出血：慢性肠炎黏膜长期充血、糜烂、溃疡，可导致血管破裂出血，表现为黏液脓血便、黑便，出血量多时可出现头晕、乏力等贫血或休克症状。
2.肠穿孔：溃疡深达肠壁全层时可引发穿孔，多表现为突发剧烈腹痛、腹肌紧张、发热等急腹症症状，需紧急手术处理。
3.肠道狭窄/梗阻：炎症反复刺激导致肠壁纤维化、瘢痕形成，引起肠道狭窄，严重时可出现肠梗阻，表现为腹痛、呕吐、停止排气排便。
4.营养不良：长期腹泻、肠道吸收功能障碍，可导致蛋白质、维生素、微量元素吸收不足，出现消瘦、乏力、低蛋白血症等。
5.水电解质紊乱：频繁腹泻、呕吐丢失大量水分及钠、钾、氯等电解质，引发脱水、低钠血症、低钾血症，表现为口渴、乏力、心律失常。
6.肛周病变：多见于溃疡性结肠炎，可出现肛周脓肿、肛瘘、肛裂，表现为肛周疼痛、流脓、排便不适。
7.肠道菌群失调：慢性肠炎破坏肠道微生态平衡，有益菌减少、有害菌增多，加重腹泻、腹胀，形成恶性循环。
8.贫血：肠道慢性出血导致缺铁性贫血，或吸收障碍导致巨幼细胞性贫血，表现为面色苍白、头晕、心悸。
9.肠道癌变：长期慢性炎症如溃疡性结肠炎病程超10年刺激肠黏膜上皮异常增生，增加结肠癌、直肠癌癌变风险。
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