脑膜脑炎的治疗以病因治疗联合对症支持为主：细菌感染者选用易透过血脑屏障的敏感抗生素如头孢曲松；病毒感染者早期应用阿昔洛韦等抗病毒药物；真菌感染者予氟康唑等抗真菌药；颅内压升高者用甘露醇等脱水剂降颅压；伴高热、抽搐者行物理降温、抗惊厥处理，同时维持水电解质平衡、保证营养供给。
脑膜脑炎的治疗周期是一个需依据病原体类型、病情轻重程度灵活判定的周期，核心目标是清除颅内感染源、缓解临床症状、预防神经功能损伤等严重并发症。典型的治疗周期如下：
1.短期周期：多见于急性病毒性脑膜脑炎，通常治疗周期为7-14天，采用针对性抗病毒药物治疗，多数患者可在数周内完全康复，预后较好；
2.中期周期：多见于细菌性脑膜脑炎，一般治疗周期为10-21天，需足量、足疗程使用敏感抗生素，以彻底清除颅内细菌感染，避免转为慢性病变；
3.长期周期：多见于结核性脑膜脑炎、自身免疫性脑膜脑炎等特殊类型，治疗周期可达6个月至1年以上，需长期规范用药，同时定期复查脑脊液、神经功能等指标，调整治疗方案。
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