小儿麻痹症的病因是感染脊髓灰质炎病毒，该病毒经粪-口途径侵入人体，在消化道黏膜上皮细胞内增殖后进入血液引发病毒血症，进一步侵犯中枢神经系统的脊髓灰质前角运动神经元，导致相关神经受损而发病。
小儿麻痹症即脊髓灰质炎的核心原因是脊髓灰质炎病毒感染及宿主免疫状态异常，病原体经粪口途径传播，5岁以下易感幼儿感染后易引发肢体瘫痪。
其核心原因可分为2条。
1.脊髓灰质炎病毒感染占比95%以上：小儿麻痹症的主要致病因子为脊髓灰质炎病毒，属肠道病毒科，主要通过污染的食物、水或密切接触等粪-口途径侵入人体，在消化道黏膜局部增殖后，部分突破防御系统引发病毒血症，进一步侵犯脊髓前角运动神经元，造成不可逆神经损伤，是发病的根本原因。
2.宿主特异性免疫不足占比约80%的瘫痪病例与该因素相关：未接种脊髓灰质炎疫苗、机体特异性免疫尚未建立完善的幼儿，感染病毒后难以将其清除，病毒易侵入中枢神经系统，进而进展为瘫痪型病例；免疫缺陷人群感染后重症风险也显著升高。
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