空鼻综合征的主要病因以医源性损伤最为常见，多因鼻腔手术如下鼻甲过度切除、正常鼻甲组织误切、鼻腔鼻窦肿瘤放疗后鼻甲黏膜及鼻甲组织放射性损伤萎缩所致；此外，鼻部严重创伤、特殊感染破坏鼻甲正常结构与功能，导致鼻甲组织过度缺失，也可能诱发本病。
空鼻综合征的核心原因可分为2条，主要与鼻腔结构及功能的医源性损伤相关，多为鼻腔手术不当引发的并发症。
其核心原因可分为2条
1.下鼻甲组织过度切除原因占比约85%
临床常见于下鼻甲部分切除术、低温等离子鼻甲消融术等操作，术中过度切除鼻甲黏膜及骨质，破坏鼻腔正常通气调节的核心结构，导致鼻腔过度宽敞，气流未经充分加湿、加温，引发干燥、鼻塞、气流紊乱等空鼻症状。
2.鼻腔黏膜及神经调节异常原因占比约15%
除直接手术切除外，术后鼻腔黏膜慢性炎症、神经末梢损伤导致的气流感知功能异常，会加重空鼻相关不适，形成症状恶性循环。
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