眼蝇蛆病的病因为蝇类幼虫蛆侵入眼部组织所致。多由狂蝇、家蝇等蝇类的雌虫将卵或幼虫直接产在眼部，或通过被蝇卵污染的手、衣物、水源等接触眼部，致使蝇卵在眼内孵化成幼虫，幼虫寄生于结膜囊、角膜、眶内等眼组织，进而引发本病。
引起眼蝇蛆病的核心原因是蝇类幼虫侵入眼部组织，主要与蝇类对眼部的侵袭行为及宿主眼部防护不足相关，具体核心原因可分为以下2条。
其核心原因可分为2条
1.蝇类直接侵袭眼部占比约90%以上，多为蝇类在结膜囊、眼睑等眼周部位产卵或产出幼虫，幼虫侵入眼组织引发感染，常发生于户外劳作、活动且未做好眼部防护的人群。
2.眼部暴露与局部条件异常占比约10%以内，当眼部存在外伤、分泌物增多或闭合不全时，易吸引蝇类停留产卵，若未及时清洁眼部，幼虫可侵入眼内寄生致病。
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