气管结核的病因主要是结核分枝杆菌感染，绝大多数为继发性，90%以上继发于肺结核，结核菌可通过肺结核病灶直接蔓延至气管黏膜，也可经淋巴道、血行播散侵入气管黏膜及黏膜下层；少数为原发性气管结核，可因气管黏膜接触含结核菌的分泌物等直接感染引发。
气管结核的核心原因可分为结核分枝杆菌感染，常继发于肺部或支气管周围结核病灶，少数为原发感染，多通过淋巴、血行播散或病灶直接破溃侵犯气管黏膜及黏膜下层，也可因带菌痰液长期刺激引发感染。
其核心原因可分为3条
1.邻近结核病灶直接蔓延占比约70%
这是气管结核最主要的原因，多由肺结核病灶或支气管旁淋巴结结核直接破溃，结核分枝杆菌侵犯气管黏膜及黏膜下层，引发特异性结核炎症病变，是导致气管结核的首要感染途径。
2.淋巴播散感染占比约20%
肺门、纵隔等部位的淋巴结结核，结核菌经淋巴引流通路累及气管壁，先引发气管壁淋巴结病变，进一步扩散至气管黏膜，形成结核病灶，是次要感染途径之一。
3.血行播散感染占比约10%
全身粟粒性肺结核等血行播散型结核，结核菌经血循环到达气管黏膜血管，定植繁殖引发感染，临床相对少见，多伴随全身结核播散的相关症状。
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