小儿消化不良的诊断依据为：症状上，出现餐后饱胀、早饱、上腹胀痛、嗳气、恶心、呕吐等不适，持续或反复发作至少4周；辅助检查需通过血常规、粪常规、腹部B超等，排除消化道感染、器质性病变如溃疡、胆道疾病及全身性疾病，同时排除胃食管反流病等其他儿童消化道疾病，结合临床症状与检查结果综合判定。
小儿消化不良诊断流程包括
1.病史采集
详细询问患儿喂养史包括母乳/配方奶喂养情况、辅食添加种类、量及进程，症状出现的时间、诱发因素如进食高脂食物、过饱、持续频率，有无伴随症状呕吐、腹胀、腹泻、便秘、烦躁哭闹、生长发育落后等，同时排查近期是否存在受凉、服用特殊药物、上呼吸道感染等诱因，以及家族中有无消化功能异常相关病史。
2.体格检查
常规测量患儿体重、身高、头围，评估生长发育水平；进行全身体格检查，重点对腹部进行视诊有无腹胀、肠型、触诊有无腹部压痛、包块、腹肌紧张、听诊肠鸣音是否正常，同时检查口腔、咽喉部等，排除口腔疾病、咽喉炎症等其他可能引发消化道症状的疾病。
3.辅助检查
根据患儿具体情况选择针对性辅助检查：大便常规检查排查是否存在肠道感染；血常规、血生化含肝功能、电解质、血糖等排查有无感染、营养缺乏或代谢异常；必要时行腹部B超，排除胃肠道器质性病变如肠套叠、先天性消化道畸形等；若怀疑与幽门螺杆菌感染相关，可酌情行碳13/14呼气试验或粪便抗原检测。
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