肉芽肿性肝炎需针对病因治疗：结核感染者予异烟肼、利福平等规范抗结核治疗；真菌感染者选用氟康唑等抗真菌药物；病因不明或合并严重免疫异常者，可短期小剂量应用糖皮质激素或免疫抑制剂，同时辅以保肝、退黄、降酶等对症支持治疗，定期监测肝功能及相关指标调整方案。
肉芽肿性肝炎的治疗周期是一个长期的疾病管理周期，核心目标是明确病因、消除肝内肉芽肿病灶、逆转肝细胞炎症损伤、预防肝硬化及肝功能衰竭等严重并发症。典型的治疗周期如下：1.感染性肉芽肿性肝炎：针对结核分枝杆菌、真菌等病原体，采用规范抗感染治疗，结核性肉芽肿性肝炎需完成6-9个月的抗结核疗程，包括2个月强化期联合用药、4-7个月巩固期规范用药；真菌性肉芽肿性肝炎疗程为3-6个月，需持续至影像学及实验室指标显示病灶完全消退。2.自身免疫性/结节病相关性肉芽肿性肝炎：需长期用药控制病情，初始治疗糖皮质激素联合免疫抑制剂持续3-6个月，待炎症缓解后以小剂量药物维持1-2年，部分病情反复者需终身低剂量维持治疗，防止肉芽肿复发及肝损伤进展。
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