念珠菌感染需根据感染部位及严重程度选择治疗方案：皮肤黏膜浅部感染可外用抗真菌药物，如克霉唑乳膏、咪康唑散，口腔念珠菌病可用制霉菌素含漱或局部涂药；深部内脏等严重感染需口服或静脉使用抗真菌药，如氟康唑、伊曲康唑，难治性病例可选用棘白菌素类药物；同时需注意个人卫生，保持感染部位清洁干燥，避免滥用抗生素及糖皮质激素。
念珠菌感染的治疗周期是一个依感染类型判定的周期，核心目标是彻底清除念珠菌、缓解症状、预防复发。典型的治疗周期如下：1.短期疗程：适用于浅部念珠菌感染，如口腔黏膜念珠菌病、外阴阴道念珠菌病，通常疗程为7-14天，采用局部抗真菌药物如制霉菌素制剂或短期口服抗真菌药物即可治愈；2.中期疗程：适用于深部侵袭性念珠菌感染，如念珠菌血症、内脏器官念珠菌病，需全身应用抗真菌药物，疗程多为2-4周，若患者存在免疫缺陷等基础疾病，需适当延长疗程，以彻底清除病原菌，避免病情反复或转为慢性感染。
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