小儿淋巴结炎的具体病因主要与感染相关，常见致病菌为溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌等，多继发于上呼吸道感染、扁桃体炎、中耳炎、牙龈炎等邻近器官组织的炎症蔓延；也可由EB病毒、柯萨奇病毒等病毒感染引发；少数情况下可因结核分枝杆菌感染导致；此外，皮肤黏膜破损后病原体侵入淋巴结，或是全身感染性疾病累及淋巴结，也会诱发该病。
小儿淋巴结炎的主要病因分为感染性与非感染性，感染因素占绝大多数，因小儿免疫系统尚未发育成熟，淋巴结作为免疫防御器官，易对局部炎症刺激产生反应，引发淋巴结炎，是小儿时期的常见病症。
其核心原因可分为2条
1.感染因素占比约80%：小儿呼吸道、皮肤、口腔等易受病原体侵袭，如溶血性链球菌、金黄色葡萄球菌引发的上呼吸道感染、扁桃体炎、皮肤脓疱疮等，病原体沿淋巴管侵入所属区域淋巴结，引发炎症。
2.非感染因素占比约15%：相对少见，如药物、食物过敏引发的变态反应，或川崎病等免疫性疾病，可导致淋巴结出现非感染性炎症，部分邻近组织损伤也可能刺激淋巴结引发炎症。
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