IgG缺乏的病因分为先天性和获得性两类，先天性病因主要是遗传因素，如常见变异型免疫缺陷病、X连锁无丙种球蛋白血症等，因B细胞发育或分化异常导致IgG生成不足；获得性病因包括反复感染对IgG的消耗，长期使用糖皮质激素、化疗药物等免疫抑制剂，肾病综合征致IgG从尿液丢失，营养不良、恶性肿瘤干扰免疫球蛋白合成，部分病毒或自身免疫病影响体液免疫功能等。
IgG缺乏的主要原因可分为先天性免疫发育异常和后天免疫功能损伤两大类，前者与遗传因素直接相关，后者多由疾病、药物或外部因素影响免疫系统引发。
其核心原因可分为2条
1.先天性免疫缺陷原因占比约30%，多由调控B细胞分化、免疫球蛋白合成的基因突变所致，阻碍IgG的正常生成，常见于原发性免疫缺陷患者，可能同时伴随其他免疫球蛋白亚型的缺乏。
2.继发性免疫损伤原因占比约70%，多由后天因素破坏免疫系统功能，如慢性病毒/细菌感染、自身免疫性疾病、长期使用糖皮质激素等免疫抑制剂、恶性肿瘤放化疗等，这些因素干扰IgG的合成、分泌或代谢，导致血清IgG水平降低。
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