根尖周脓肿的病因主要为牙髓感染未及时控制并向根尖周组织扩散，如深龋、楔状缺损、牙隐裂等引发牙髓炎后，炎症蔓延至根尖周形成化脓性炎症；其次，根管治疗不彻底，残留细菌及坏死组织可诱发根尖周慢性炎症急性发作；此外，牙齿外伤未妥善处理、咬合创伤导致根尖周组织损伤继发感染，也可成为本病的诱因。
根尖周脓肿的核心诱因是根尖周组织的化脓性感染，多由牙髓病变进展、牙周感染逆行侵入或医源性/创伤因素诱发，致病微生物及其毒素刺激根尖周组织，引发急性炎症反应，导致组织坏死液化形成脓肿。
其核心原因可分为3条
1.牙髓感染扩散原因占比约80%：深龋、急性牙髓炎等牙髓疾病未及时干预，细菌及其毒素经根尖孔侵入根尖周组织，引发急性化脓性炎症，是该病最主要的病因。
2.牙周病变逆行感染原因占比约10%：重度牙周炎患者的深牙周袋内致病微生物，通过根尖孔或侧支根管逆行侵入根尖周组织，诱发化脓性炎症形成脓肿。
3.医源性或创伤因素原因占比约10%：根管治疗操作不当如器械超出根尖孔、消毒不彻底，或牙齿受外伤后牙髓坏死继发感染，进而引发根尖周脓肿。
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