上颌后缩的病因主要分为先天与后天两类：先天因素包括胚胎发育期上颌骨发育障碍，可能与遗传、母体孕期感染、营养不良、接触致畸物质如放射线、某些药物有关；后天因素包括儿童期长期不良口腔习惯如吮指、咬下唇、口呼吸，腭裂继发上颌发育不足，上颌骨外伤后愈合不良，或颞下颌关节疾病影响上颌正常发育。
上颌后缩是常见的牙颌面畸形，其核心原因主要涉及先天发育、后天不良口腔习惯及相关疾病/创伤三个方面，不同原因的占比各有差异。
其核心原因可分为3条
1.先天性发育异常约占45%
胚胎时期上颌骨发育受阻是主要诱因，遗传因素可直接影响颌骨发育模式；胎儿期宫内营养不良、母体孕期感染如风疹、接触致畸药物或放射线等，也会干扰上颌骨正常生长，导致上颌骨长度、高度发育不足，引发后缩。
2.后天不良口腔习惯约占35%
儿童时期长期存在吮指、咬下唇、口呼吸等不良习惯，会持续对颌骨及牙列产生异常压力：吮指易推压上颌牙弓使腭穹窿变窄，口呼吸改变口腔内正常压力环境，共同限制上颌骨向前发育，逐步形成上颌后缩。
3.疾病与创伤因素约占20%
儿童期腺样体肥大导致长期张口呼吸、鼻窦炎等呼吸道疾病，会间接影响颌骨发育；颌面部外伤致上颌骨骨折后愈合错位，或上颌骨肿瘤切除术后骨组织缺损，也会直接造成上颌骨形态、位置异常，表现为上颌后缩。
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