沈阳市第六人民医院是一家以治疗肝病、结核病为特色的市级综合性医院。医院设有以下科室：
肝病科：是医院的重点科室，拥有多位知名肝病专家，开展了人工肝支持系统治疗重型肝炎、腹水回输治疗肝硬化等特色治疗项目。
结核病科：是辽宁省结核病临床治疗中心，对各种结核病的诊断和治疗具有丰富的经验。
感染科：承担着各种感染性疾病的诊治任务，包括手足口病、麻疹、水痘等。
内科：包括呼吸、消化、心血管、内分泌等专业，为患者提供全面的内科医疗服务。
外科：可开展普外、胸外、脑外等手术，为患者提供专业的外科治疗。
妇产科：提供妇科、产科的常见病、多发病的诊治服务。
儿科：诊治儿童各种疾病。
眼科：开展眼科常见病、多发病的诊治。
口腔科：提供口腔疾病的诊治服务。
皮肤科：治疗各种皮肤疾病。
中医科：运用中医中药治疗各种疾病。
急诊科：24小时应诊，为急危重症患者提供及时的救治。
检验科：提供各种临床检验服务。
影像科：包括放射、超声、CT、磁共振等检查，为临床诊断提供有力支持。
药剂科：为患者提供药品供应和药学服务。
此外，医院还设有病理科、麻醉科、营养科等科室，为患者提供全面的医疗服务。
