确诊莱姆病需行血液、脑脊液检查，检测出螺旋体抗体。从血液、脑脊液及病变皮肤等标本中可分离出螺旋体。采用免疫荧光、免疫转印等方法可在患者血中测出特异性抗体。病原体分离及特异性抗体检测具有确诊意义。聚合酶链反应（PCR）技术：检测患者血、尿、脑脊液及皮肤标本等莱姆病螺旋体DNA（Bb-DNA），并同时可测出所感染菌株的基因型。脑电图、头颅CT和MRI检査多为正常，慢性期CT及MRI可显示脑部的多灶性病变及脑室周围损害。可排除颅内其他病变。