病因明确的矮小症可以针对病因进行治疗，而病因不明确的矮小症目前还没有特效的疗法，辅助治疗可以取得积极的治疗效果。病因治疗甲状腺功能减退症者，需要甲状腺片治疗。肾上腺皮质功能减退者，可以选用氢化可的松进行治疗。对于患有全身性慢性疾病的人，如吸收不良等，可以针对胃肠道疾病进行治疗。辅助治疗合理喂养，均衡饮食，养成不挑食、不偏食等良好的饮食习惯。加强运动，可以多做一些对骨骼造成纵向压力的运动，如慢跑、跳绳、跳舞、打篮球等。保证睡眠，保证孩子有充足的睡眠，年龄越小的孩子，需要睡觉的时间就越长。保持良好的情绪对身高的增长也有一定的好处，不要给孩子过多的压力，多多关心、爱护孩子，成为孩子的朋友。生长激素治疗如果是由于生长激素缺乏而引起的矮小症，应用生长激素治疗可以取得积极的治疗效果。不是由于生长激素缺乏引起的矮小症，足够疗程的生长激素治疗也可以取得一定的效果。