特应性皮炎的发病原因目前尚未完全明确，与遗传和环境等因素关系密切。遗传父母亲等家族成员有过敏性疾病史的人，患本病的概率显著增加，遗传因素会影响皮肤的屏障功能与免疫功能。自身免疫许多免疫细胞及其产生的细胞因子、趋化因子及前炎症分子等可参与发病。环境因素包括环境变化、生活方式改变、过度洗涤、感染原和变应原等。心理因素如精神紧张、焦虑、抑郁等，也在特应性皮炎的发病中有一定作用。