皮下脂肪瘤的发病原因尚不完全清楚，普通孤立性脂肪瘤与12号染色体的重组有关。在肥胖人群、糖尿病和血清胆固醇水平较高的人群中，脂肪瘤的发病率较高。有时创伤后局部也有脂肪瘤存在，但创伤是否引起脂肪瘤发病尚不明确。多发患者可有家族史。