尿道肉阜的病因不十分明确，可能由于下列因素引起尿道口周围上皮细胞增生，炎细胞浸润及小静脉曲张等变化，从而形成尿道肉阜。由于外阴慢性炎症，或性交、卫生纸等慢性刺激引起。尿道黏膜外翻，受到慢性刺激导致。尿道梗阻或者其他原因使排尿时过度用力，黏膜下小静脉壁变薄，曲张。